More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0985 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
193 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  87.05 
 
 
193 aa  342  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  64.06 
 
 
192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  59.38 
 
 
192 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  60.75 
 
 
191 aa  224  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  58.45 
 
 
209 aa  221  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  64.74 
 
 
189 aa  215  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  60.21 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  62.78 
 
 
184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  62.78 
 
 
184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  62.78 
 
 
184 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  54.12 
 
 
206 aa  206  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  56.91 
 
 
194 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  58.85 
 
 
190 aa  204  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  55.38 
 
 
201 aa  204  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  56.67 
 
 
186 aa  204  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  61.41 
 
 
195 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  65.17 
 
 
186 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  54.59 
 
 
184 aa  197  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  54.64 
 
 
189 aa  195  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  56.04 
 
 
190 aa  194  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  52.88 
 
 
207 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  52 
 
 
216 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  60.53 
 
 
189 aa  190  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  48.02 
 
 
211 aa  175  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  47.8 
 
 
194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  42.2 
 
 
227 aa  154  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  45.21 
 
 
194 aa  154  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  47.78 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  45.86 
 
 
191 aa  151  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  41.21 
 
 
204 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  44.44 
 
 
207 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  40.93 
 
 
192 aa  142  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  43.41 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  38.69 
 
 
197 aa  121  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  41.5 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  36.41 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  40.2 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.41 
 
 
209 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  47.62 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  37.76 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  42.78 
 
 
201 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.44 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  39.11 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  38.78 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.78 
 
 
201 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  39.7 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  36 
 
 
213 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.5 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.5 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.18 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.64 
 
 
215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.5 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.5 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  35.18 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.5 
 
 
213 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  35.5 
 
 
213 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.18 
 
 
210 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  35.5 
 
 
213 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.5 
 
 
213 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.32 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  38.83 
 
 
217 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  38.79 
 
 
210 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  40.94 
 
 
207 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  39.01 
 
 
201 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.04 
 
 
213 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.43 
 
 
206 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  38.79 
 
 
210 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  41.76 
 
 
208 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 
196 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  36.25 
 
 
199 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.12 
 
 
213 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  35.87 
 
 
206 aa  104  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  40.64 
 
 
213 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.32 
 
 
215 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  34.97 
 
 
201 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  38.71 
 
 
213 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  40.11 
 
 
225 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  39.49 
 
 
237 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  35.18 
 
 
208 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  37.82 
 
 
212 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  36.46 
 
 
210 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  40.74 
 
 
240 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  37.99 
 
 
240 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  39.23 
 
 
221 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  38.58 
 
 
208 aa  101  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  39.04 
 
 
213 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  31.37 
 
 
208 aa  101  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40.53 
 
 
198 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  37.62 
 
 
238 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  39.04 
 
 
207 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  40.96 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  35.96 
 
 
215 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2887  nicotinamidase  37.99 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 
195 aa  97.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  36.56 
 
 
221 aa  97.1  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33.49 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.54 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.46 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>