278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1003 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 189 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  74.74 
 
 		 192 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  68.42 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  72.34 
 
 		 190 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  68.48 
 
 		 184 aa  255  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  65.46 
 
 		 206 aa  253  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  69.89 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  69.15 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  65.75 
 
 		 186 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  64.86 
 
 		 189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  65.22 
 
 		 201 aa  230  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  60.87 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  70 
 
 		 184 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  70 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  70 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  70.11 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  68.06 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  61.17 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  69.78 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  55.79 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  60.53 
 
 		 193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  62.01 
 
 		 190 aa  208  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  53.14 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  56.35 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  50.46 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  47.96 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  53.26 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  54.95 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  52.75 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  44.5 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  46.52 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  47.47 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  46.24 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  52.04 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40.32 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  39.2 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.59 
 
 		 209 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  36.1 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.29 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  40.89 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  35.68 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  38.92 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  36.1 
 
 		 209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  39.8 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.85 
 
 		 212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  38.89 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  43.09 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  34.5 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  40.11 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  39.8 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  42.94 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  39.29 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  39.8 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.98 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  40.48 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  37.76 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.5 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.3 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.5 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.5 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.5 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  36.68 
 
 		 201 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  38.98 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.15 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  40.94 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.5 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  36.5 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  36.5 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.5 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  38.31 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.5 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  35.5 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  32.21 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  41.92 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  35.96 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  41.92 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  35 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2724  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.59 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00509557  hitchhiker  0.00329299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1968  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.99 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0424644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2264  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.6 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0520019  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  38.92 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  35.9 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0651  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.83 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.972154  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.51 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  38.46 
 
 		 210 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  40.59 
 
 		 212 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  39.38 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.76 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.51 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.51 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.76 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  41.76 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.15 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.15 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  38.86 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>