230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0958 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
194 aa  384  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  70.88 
 
 
194 aa  255  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  72.97 
 
 
204 aa  250  9.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  62.03 
 
 
191 aa  242  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  61.66 
 
 
207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  57.58 
 
 
204 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  51.65 
 
 
186 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  51.61 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  49.73 
 
 
192 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  50.79 
 
 
192 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  52.75 
 
 
190 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
189 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  50.78 
 
 
195 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 
184 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  50.55 
 
 
184 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
184 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  44.83 
 
 
207 aa  157  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 
191 aa  157  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  45.74 
 
 
193 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  45.5 
 
 
211 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  47.22 
 
 
201 aa  153  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  53.09 
 
 
190 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  51.37 
 
 
189 aa  151  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  51.38 
 
 
190 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  51.38 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  41.12 
 
 
216 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  45.21 
 
 
193 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  43.64 
 
 
227 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  45.21 
 
 
194 aa  140  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  48.24 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
186 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  52.75 
 
 
189 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  40.84 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  44.79 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  40.2 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 
199 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 
196 aa  104  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  46.63 
 
 
199 aa  104  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  37.3 
 
 
201 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  35.16 
 
 
210 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  45.9 
 
 
198 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  37.13 
 
 
201 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  37.13 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  35.96 
 
 
208 aa  94.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  35.32 
 
 
198 aa  94  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  38.12 
 
 
201 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  35.56 
 
 
240 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  37.3 
 
 
206 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  37.62 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  38.98 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  31.19 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  35.41 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33.17 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  37.44 
 
 
213 aa  87.8  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.27 
 
 
213 aa  87.8  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  33.17 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  37.56 
 
 
221 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.1 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.1 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
192 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  36.95 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.72 
 
 
213 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  33.67 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  36.22 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.61 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.63 
 
 
218 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  32.97 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0861  nicotinamidase  38.04 
 
 
240 aa  85.9  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.522255  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.63 
 
 
218 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.63 
 
 
218 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.63 
 
 
218 aa  85.1  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.78 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  34.78 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.78 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.15 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.78 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  35 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.3 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.02 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  34.78 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  38.17 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  38.76 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1369  nicotinamidase  36.96 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0678312  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  37.57 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  37.5 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  35.71 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1928  nicotinamidase  35.64 
 
 
210 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  35.61 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3904  nicotinamidase  35.61 
 
 
225 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.303897 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  34.63 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  35.29 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  33.5 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  34.01 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.75 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  37.89 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1823  nicotinamidase  36.41 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.604987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>