223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1959 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  70.88 
 
 		 194 aa  255  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  73.91 
 
 		 204 aa  255  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  57.64 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  58.38 
 
 		 191 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  56.31 
 
 		 207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  53.68 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  53.19 
 
 		 192 aa  184  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  54.14 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  50.54 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  54.1 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  54.1 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  53.55 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  50.27 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  52.72 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  47.64 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  47.37 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  49.46 
 
 		 206 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 		 184 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  48.95 
 
 		 211 aa  157  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  49.73 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  50.3 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  52.94 
 
 		 195 aa  154  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  47.12 
 
 		 194 aa  154  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  47.03 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  47.8 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  42 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  45.74 
 
 		 189 aa  151  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  53.26 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  48.91 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  53.26 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  42.6 
 
 		 227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  45.81 
 
 		 199 aa  127  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  44.63 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  43.94 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  34.98 
 
 		 208 aa  97.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2870  nicotinamidase  36.71 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  33.49 
 
 		 208 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  34.16 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  35.82 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  33.74 
 
 		 210 aa  91.7  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  32.97 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  35.82 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  35.44 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  32.38 
 
 		 208 aa  87.8  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.64 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.64 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  34.62 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  37.85 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.64 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.64 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.64 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  37.64 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  37.64 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  32.68 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  37.64 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  36.17 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.52 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  35.61 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  35.26 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  33.17 
 
 		 197 aa  84.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  36.23 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  36.02 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1467  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.34 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.821646  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  33.01 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  35.64 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  36.22 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0271  nicotinamidase  30.84 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.71 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  32.2 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  33.49 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4507  nicotinamidase  36.27 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1394  nicotinamidase  33 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  32.52 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  32.39 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2845  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.66 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46220  nicotinamidase  34.97 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.790768  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  32.84 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.03 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2621  Nicotinamidase  29.11 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363172  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.52 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.52 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.52 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1882  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.52 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00013739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  34.45 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1387  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.52 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.073671  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.17 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  29.85 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2093  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.5 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2348  nicotinamidase/pyrazinamidase  33.33 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000299891  normal  0.0437872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.39 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.77 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>