188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  100 
 
 		 199 aa  393  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  47.24 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  44.95 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  40.64 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  46.19 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1348  isochorismatase hydrolase  51.04 
 
 		 199 aa  137  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  45.13 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  44.51 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  42 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1285  isochorismatase hydrolase  45.64 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.935011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  43.3 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1959  isochorismatase hydrolase  45.81 
 
 		 194 aa  127  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.723519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  44.79 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  39.47 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  42.64 
 
 		 186 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1089  isochorismatase hydrolase  43.9 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2734  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0379  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0262672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  40.91 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  40.34 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08090  nicotinamidase-like amidase  37.88 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0757125  normal  0.31312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  44.06 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1721  pyrazinamidase/nicotinamidase  45.76 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  43.81 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  43.81 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  43.81 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3768  isochorismatase hydrolase  40.28 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0635  Nicotinamidase-like amidase  42.19 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0133012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0932  isochorismatase hydrolase  44.5 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.732807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1301  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1003  isochorismatase hydrolase  47.96 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1717  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.74739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0985  isochorismatase hydrolase  43.41 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154351  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30390  nicotinamidase-like amidase  42.64 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33651  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5728  isochorismatase hydrolase  45.18 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  38.42 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  38.31 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0026  nicotinamidase  40.11 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  38.66 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34483  predicted protein  36.1 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.461496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  35.1 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0960  isochorismatase family protein  30 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.382034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0014  nicotinamidase  33.16 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.970304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  33.49 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2290  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  34.34 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  35.21 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2825  Nicotinamidase  34.6 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.538544  normal  0.188914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  36.22 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  36.08 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2542  Nicotinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2638  Nicotinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  34.45 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  34.74 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1963  isochorismatase hydrolase  34.52 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0190447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.74 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3347  nicotinamidase  32.98 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1420  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.55 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2566  Nicotinamidase  33.49 
 
 		 208 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.849459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2254  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1709  nicotinamidase  31.71 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.665452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.71 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1318  nicotinamidase  35.53 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0967005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  30.92 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  34.07 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1464  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.22 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.946061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2143  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.24 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2445  nicotinamidase  35.05 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.430733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2454  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.51 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0214  Nicotinamidase  33.33 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527047 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2293  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.51 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2332  pyrazinamidase/nicotinamidase  33.51 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  34.83 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1029  nicotinamidase  30.09 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0199  nicotinamidase  29.56 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0345  nicotinamidase/ pyrazinamidase  31.1 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1420  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.68 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.750645  normal  0.465448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1984  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.75 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4273  Nicotinamidase  38.8 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00705625  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1437  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.97 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00306349  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0323  nicotinamidase/ pyrazinamidase  30.58 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1406  nicotinamidase  32.97 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1854  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130267  normal  0.175383 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1927  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.97 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3377  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.97 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1200  pyrazinamidase/nicotinamidase  32.97 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.694975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3295  pyrazinamidase/nicotinamidase  34.62 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20048  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2053  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.68 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.143362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1893  nicotinamidase  32.24 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0189  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  33.52 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1404  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.68 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.0281019 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>