62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0388 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  44.89 
 
 
174 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0207  conserved hypothetical protein, putative amidase  40.8 
 
 
170 aa  142  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0126  putative pyrazinamidase/nicotinamidase  35.43 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.357919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0154  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  35.43 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0745833  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0114  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  34.86 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  40.34 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  33.16 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  28.28 
 
 
192 aa  61.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06120  nicotinamidase-like amidase  30.73 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  28.81 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  30.68 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  30.68 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  31.64 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  30.68 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  30.68 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  29.71 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  30.11 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  30.11 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  30.68 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
174 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.88 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  27.42 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1351  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 
191 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29250  nicotinamidase-like amidase  29.13 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.810244  normal  0.427869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  29.07 
 
 
206 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0305346 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 
203 aa  47.8  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  24.16 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1488  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1519  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
189 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226465  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1958  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
201 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.469992  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  27.27 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 
192 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  25.94 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08310  nicotinamidase-like amidase  25 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  28.17 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0678  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  27.74 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0274495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10680  nicotinamidase-like amidase  25.13 
 
 
211 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107249  normal  0.953023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0187  Nicotinamidase  27.98 
 
 
240 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2319  isochorismatase hydrolase  24.59 
 
 
207 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
289 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 
214 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12080  pyrazinamidase/nicotinamidase pncA  26.74 
 
 
186 aa  41.2  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2415  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.11 
 
 
207 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.868492  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>