More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1336 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
204 aa  420  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  63.5 
 
 
199 aa  278  3e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  60.71 
 
 
203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  58 
 
 
201 aa  240  9e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  54.87 
 
 
196 aa  239  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  56.93 
 
 
214 aa  229  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  55.22 
 
 
201 aa  229  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  56 
 
 
201 aa  217  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  59.24 
 
 
201 aa  207  7e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 
193 aa  149  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  39.38 
 
 
192 aa  138  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  40.68 
 
 
190 aa  128  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  45.39 
 
 
188 aa  124  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  46.21 
 
 
176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 
174 aa  115  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  34.86 
 
 
213 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
180 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  38.75 
 
 
197 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  39.69 
 
 
174 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  38.93 
 
 
174 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 
172 aa  96.7  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  29.73 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  35.5 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  37.58 
 
 
227 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  29.19 
 
 
179 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  38.06 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 
213 aa  88.2  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  29.03 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 
176 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  28.49 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  28.49 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  28.49 
 
 
179 aa  85.1  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  28.49 
 
 
179 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  29.03 
 
 
179 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  38.12 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  28.65 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  32.52 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  32.52 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.25 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.52 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  32.52 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
329 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.9 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.98 
 
 
244 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  30.49 
 
 
184 aa  79  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  33.75 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  31.02 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  31.02 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.9 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.73 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  33.94 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  33.54 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  33.54 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  31.03 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1355  isochorismatase hydrolase  32.94 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  32.74 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30.89 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  33.84 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.05 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>