More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1454 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  100 
 
 		 184 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  71.2 
 
 		 186 aa  286  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  71.2 
 
 		 186 aa  286  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  55 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  54.4 
 
 		 183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  54.7 
 
 		 182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  54.44 
 
 		 182 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  54.44 
 
 		 182 aa  210  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  53.89 
 
 		 182 aa  209  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  53.89 
 
 		 182 aa  208  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  53.89 
 
 		 182 aa  207  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  52.2 
 
 		 183 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  51.65 
 
 		 183 aa  202  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  53.63 
 
 		 181 aa  201  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  51.11 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  51.67 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  51.1 
 
 		 184 aa  193  9e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  51.4 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  48.89 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  48.35 
 
 		 182 aa  184  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  53.92 
 
 		 102 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  38.86 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 		 178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 185 aa  103  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 199 aa  87.8  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.53 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  31.52 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  26.7 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1211  nicotinamidase  28.98 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0305346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  23.63 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  29.71 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2587  isochorismatase hydrolase  25.26 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  25.88 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  24.06 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  24.73 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  22.35 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  26.98 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  27.61 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  24.44 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  31.91 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  31.91 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1096  isochorismatase hydrolase  24.04 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.843144  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  24.57 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2040  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  24.31 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  28.02 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  35.44 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  28.02 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  25.43 
 
 		 196 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.85 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  22.7 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  26.09 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  32.05 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  32.05 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.83 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  32.05 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>