More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1242 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  74.86 
 
 		 183 aa  287  8e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  73.08 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  59.67 
 
 		 182 aa  234  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  59.67 
 
 		 182 aa  234  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  59.12 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  59.12 
 
 		 182 aa  232  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  59.67 
 
 		 182 aa  232  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  59.12 
 
 		 182 aa  231  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  58.01 
 
 		 182 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  57.46 
 
 		 182 aa  228  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  59.02 
 
 		 183 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  57.92 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  56.83 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  52.75 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  51.4 
 
 		 184 aa  188  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  51.1 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  49.72 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  58.42 
 
 		 102 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 180 aa  85.5  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  37.5 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  34.18 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  28.88 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  39.47 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  39.47 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  39.47 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  39.47 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  39.47 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  40.23 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  37.93 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  38.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  38.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  38.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  38.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  38.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  38.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  30.63 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  38.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  38.03 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  37.93 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  40.58 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  40.59 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  40.59 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  40.59 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  41.1 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27.03 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.61 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  26.32 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  41.33 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  43.06 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  39.74 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  24.08 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  39.74 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  48.28 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  38.16 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  45.31 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>