More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0467 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  100 
 
 
190 aa  377  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  94.21 
 
 
190 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  94.21 
 
 
190 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  93.68 
 
 
190 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  93.68 
 
 
190 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  93.68 
 
 
190 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  93.68 
 
 
190 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  93.68 
 
 
190 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  41.22 
 
 
190 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 
204 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 
200 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  36.25 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  39.79 
 
 
212 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  35.14 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 
194 aa  87.8  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  33.83 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  34.75 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  32.46 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
234 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.57 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.27 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.77 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.2 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  31.41 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  29.19 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  32.26 
 
 
533 aa  71.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.33 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  34.51 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.22 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.65 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  34.34 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  34.34 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  34.34 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  34.34 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  34.34 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  34.34 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
239 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  34.34 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 
240 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
239 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  43.59 
 
 
232 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.95 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
239 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  50 
 
 
281 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 
235 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 
236 aa  61.6  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  30.82 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
217 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  38.21 
 
 
216 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 
198 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  26.73 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  29.46 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.5 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  38.16 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  37.5 
 
 
217 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  37.5 
 
 
217 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  28.87 
 
 
223 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 
172 aa  58.2  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>