More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5987 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  100 
 
 		 204 aa  416  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  74.02 
 
 		 207 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  61.66 
 
 		 201 aa  251  6e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  60.1 
 
 		 200 aa  243  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  55.1 
 
 		 204 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  54.04 
 
 		 222 aa  207  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  35.14 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  32.99 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  35.64 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  35.64 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  34.95 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.55 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.55 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.55 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.55 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.07 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  34.27 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.07 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.5 
 
 		 389 aa  71.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.6 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  29.29 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  29.51 
 
 		 533 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  30.43 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  30.37 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.21 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.44 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.06 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  29.35 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.84 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  23.72 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.15 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  37.96 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  29.44 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  29.76 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  29.76 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  29.76 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  29.76 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  28.79 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  28.79 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  29.76 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  28.79 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  28.79 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  28.79 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  29.76 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  29.76 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>