More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4718 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  35.86 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  35.86 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  35.86 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  35.86 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  35.68 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  35.35 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  36.56 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  38.83 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 248 aa  104  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  37.25 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 244 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  38.82 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  37.2 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 248 aa  99  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 329 aa  98.2  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  34.71 
 
 		 241 aa  98.2  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  33.89 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0804  isochorismatase hydrolase  35.18 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 		 240 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.61 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 		 224 aa  85.5  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  32.42 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.82 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  34.48 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.8 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  34.31 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  36.16 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29.35 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  32.18 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  32.18 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  32.18 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  32.18 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1914  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.652638  normal  0.010767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  32.18 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  35.06 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  30.39 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  33.85 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>