More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1578 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 264 aa  540  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  66.54 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  61.83 
 
 		 266 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  54.47 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  40.19 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 232 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  35.21 
 
 		 389 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  33.19 
 
 		 233 aa  132  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  34.76 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  36.97 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.73 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  32.27 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  32.27 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  36.97 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  32.27 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.27 
 
 		 231 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.27 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.82 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  34.84 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  32.44 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  34.45 
 
 		 230 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  35.81 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.29 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  36.36 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  36.49 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  35.89 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 		 248 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  35.21 
 
 		 239 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  36.1 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.14 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  35.41 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  32.51 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  35.27 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 		 241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  32.38 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  33.83 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31 
 
 		 244 aa  109  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.49 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  32.13 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.62 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  34.8 
 
 		 213 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  33.62 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.19 
 
 		 226 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  28.51 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  32.63 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.23 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.21 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  31.39 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  31.39 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  31.39 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  33.94 
 
 		 229 aa  92  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  32.51 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.4 
 
 		 191 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 201 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 201 aa  89.4  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 224 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  27.1 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  35.19 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.23 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.4 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  28.84 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>