More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0848 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
236 aa  485  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  66.36 
 
 
231 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  61.67 
 
 
231 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  65.3 
 
 
223 aa  284  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  64.19 
 
 
223 aa  275  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  60.19 
 
 
240 aa  272  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  62.33 
 
 
232 aa  270  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  62.56 
 
 
222 aa  269  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  62.1 
 
 
222 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  60.36 
 
 
225 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  58.04 
 
 
225 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  63.43 
 
 
229 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  56.7 
 
 
230 aa  258  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  59.56 
 
 
230 aa  257  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  59.56 
 
 
230 aa  257  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  56.74 
 
 
236 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  60.1 
 
 
228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  56.22 
 
 
240 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  59.82 
 
 
226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  59.36 
 
 
226 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  60 
 
 
226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  57.35 
 
 
223 aa  238  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  57.21 
 
 
233 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  46.95 
 
 
281 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  56.19 
 
 
222 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  56.19 
 
 
222 aa  221  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  56.19 
 
 
222 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  48 
 
 
232 aa  198  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  47.93 
 
 
247 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  44.93 
 
 
227 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  46.01 
 
 
227 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  46.15 
 
 
227 aa  189  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  48.39 
 
 
241 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  46.64 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  41.74 
 
 
230 aa  188  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  45.54 
 
 
234 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  45.79 
 
 
228 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  45.54 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  43.64 
 
 
233 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  43.46 
 
 
228 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  41.7 
 
 
389 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  44.09 
 
 
239 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  43.24 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  44.09 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  43.24 
 
 
234 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  43.64 
 
 
239 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  41.89 
 
 
230 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  42.31 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  33.06 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.44 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.79 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.79 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.57 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.79 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.36 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.13 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 
248 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.87 
 
 
233 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
264 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.49 
 
 
274 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.66 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  29.36 
 
 
224 aa  99  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  29.68 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
266 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  26.36 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  28.63 
 
 
248 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
200 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  26.82 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.64 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 
196 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.55 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.73 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  28.78 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  25.54 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  35.86 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
201 aa  72  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>