More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3021 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  63.13 
 
 		 223 aa  279  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  62.26 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  61.79 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  62.33 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  59.91 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 281 aa  255  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  57.08 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  56.02 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  53.88 
 
 		 222 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  58.33 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  60.75 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  57.55 
 
 		 240 aa  241  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  53.24 
 
 		 222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  58.45 
 
 		 226 aa  238  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  57.99 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  59.45 
 
 		 230 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  59.45 
 
 		 230 aa  234  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  57.53 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  55.45 
 
 		 223 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  54.46 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  57.41 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  55.09 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  52.49 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  52.49 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  52.49 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  47.79 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  46.7 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  49.29 
 
 		 247 aa  203  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  48.02 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  48.65 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  50.5 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  49.55 
 
 		 233 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  45.05 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  50.68 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  47.57 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  47.85 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  45.58 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  46.54 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  45.24 
 
 		 234 aa  191  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  46.76 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  47.3 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  42.61 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  42.61 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  46.85 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  46.85 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  44 
 
 		 389 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  41.28 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.3 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.42 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.42 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.42 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.42 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  35.29 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.82 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.82 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.97 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.05 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  33.48 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.19 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.54 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  30.54 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  35.61 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  24.04 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  29.94 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.41 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.5 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>