More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18103 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  54 
 
 		 201 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  54.27 
 
 		 217 aa  231  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  53.27 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  53 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  52.82 
 
 		 213 aa  222  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  51.53 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 209 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  34.34 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  32.82 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 377 aa  94.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  28.35 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.63 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29.73 
 
 		 389 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.52 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  29.52 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  28.27 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  27.14 
 
 		 533 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 227 aa  88.2  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 239 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.03 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.77 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.41 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 240 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  29.17 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.91 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  29.95 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  29.95 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  29.95 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.83 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.24 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  27.4 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.71 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  27.78 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  26.42 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  28.57 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  29.25 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.09 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  26.53 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  30 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1996  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.85 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  27 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  25.24 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1768  isochorismatase hydrolase  26.21 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7071  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00539023  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1787  isochorismatase hydrolase  26.21 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  26.24 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1834  isochorismatase hydrolase  26.21 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  26.13 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  27.06 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  28.57 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>