222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1768 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1768  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1787  isochorismatase hydrolase  99.03 
 
 
207 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1834  isochorismatase hydrolase  99.03 
 
 
207 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  77.5 
 
 
204 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4334  isochorismatase hydrolase  76.88 
 
 
207 aa  279  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.366283  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8742  isochorismatase hydrolase  47.34 
 
 
235 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3647  isochorismatase hydrolase  44.57 
 
 
211 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0439304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1996  isochorismatase hydrolase  42.36 
 
 
206 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4162  isochorismatase hydrolase  37.32 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4119  isochorismatase hydrolase  40.1 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  26.7 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  25.77 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  25.37 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  26.96 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  25.45 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  25.34 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  26.02 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  26.96 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  25.62 
 
 
247 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.12 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  27.55 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
264 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  27.55 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  26.42 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.63 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 
201 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
247 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.2 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 
188 aa  62  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 
201 aa  62  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 
239 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
235 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  22.89 
 
 
230 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  27.09 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  24.38 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  30.22 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  25.13 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  26.38 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  26.38 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  26.38 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 
190 aa  58.9  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  23.15 
 
 
224 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 
217 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  25.87 
 
 
266 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  24.76 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  25.96 
 
 
225 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
189 aa  58.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  25.75 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  24.62 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  23.38 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  23.38 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  26.21 
 
 
231 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  29.9 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  29.9 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  24.17 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  24.12 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  24.27 
 
 
230 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  25.73 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  25.73 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  25.73 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  24.66 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  25.99 
 
 
389 aa  54.7  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  26.49 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  29.11 
 
 
256 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  25.73 
 
 
231 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
231 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  24.12 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  24.7 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  24.27 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  29.61 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  29.61 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  26 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  22.94 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>