More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3214 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  51.91 
 
 		 197 aa  207  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  46.24 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  42.13 
 
 		 189 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  41.9 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  43.82 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  47.52 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  40 
 
 		 223 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  39.46 
 
 		 243 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  39.67 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 		 212 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 217 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 217 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  37.89 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 217 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  33.84 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  36.11 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 204 aa  97.8  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  36.25 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  36.25 
 
 		 190 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  29.65 
 
 		 190 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 204 aa  94.7  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  36.25 
 
 		 190 aa  94.4  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 186 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  35.62 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  34.86 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  34.86 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  35.62 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  34.86 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  34.86 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  35.62 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  34.86 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  35.62 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  35.62 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  33.5 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  34.21 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  33.5 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  33.5 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  33.5 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  33.5 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  33.5 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  30.96 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  30.96 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  31.96 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  36.22 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  31.16 
 
 		 533 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  40.87 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  30.96 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  30.57 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  31.44 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 239 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  30.26 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.64 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  52.05 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  28.22 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  32.96 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  33.06 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  30.27 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.16 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>