More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1163 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 225 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  83.56 
 
 		 225 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  66.06 
 
 		 231 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  67.45 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  64.38 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  63.47 
 
 		 223 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  60.73 
 
 		 222 aa  270  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  59.82 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  60.36 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  59.91 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  62.15 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  61.35 
 
 		 240 aa  255  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  59.15 
 
 		 228 aa  254  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  57.47 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  51.46 
 
 		 281 aa  252  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  55.25 
 
 		 236 aa  247  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  60.19 
 
 		 226 aa  244  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  59.36 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  59.72 
 
 		 226 aa  241  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  57.41 
 
 		 240 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  60.87 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  58.06 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  58.06 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  56.73 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  48.43 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  53.05 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  53.52 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  53.52 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  57.07 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  57.07 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  57.07 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  50.87 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  48.79 
 
 		 389 aa  203  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  51.47 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  49.55 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  48.84 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  45.05 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  47.77 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  50.68 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  48.17 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  48.85 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  48.61 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  50.49 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  48.36 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  48.04 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  48.29 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  42.73 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  40.18 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  34.2 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  35.89 
 
 		 274 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.96 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.51 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.51 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.51 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.51 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.05 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.77 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  37.75 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  32.44 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  31.79 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.51 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  34.86 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.84 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>