More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2385 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.37 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 
248 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  32.99 
 
 
274 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 
258 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.09 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.09 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.09 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.09 
 
 
230 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.67 
 
 
231 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 
231 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  34.65 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  33.98 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
329 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.67 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29.44 
 
 
389 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  30.39 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  33.5 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  32.11 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  29.58 
 
 
266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
180 aa  89.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
217 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  31.07 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.38 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.16 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  28.84 
 
 
240 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.56 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 
233 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
234 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 
264 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.67 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 
240 aa  85.5  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
234 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.95 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  30.66 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  28.11 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
190 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27.75 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  27.88 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  28.72 
 
 
533 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  29.23 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  26.51 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  24.14 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.5 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  23.15 
 
 
214 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>