More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0764 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  72.43 
 
 		 223 aa  314  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  67.42 
 
 		 231 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  66.37 
 
 		 231 aa  296  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  61.99 
 
 		 236 aa  280  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  61.33 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  62.73 
 
 		 223 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  61.19 
 
 		 222 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  63.41 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  60.63 
 
 		 222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  61.93 
 
 		 225 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  61.01 
 
 		 240 aa  261  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  63.86 
 
 		 228 aa  258  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  61.99 
 
 		 230 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  61.99 
 
 		 230 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  59.55 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  58.82 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  62.22 
 
 		 233 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  65.58 
 
 		 226 aa  248  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  65.12 
 
 		 226 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  49.27 
 
 		 281 aa  244  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  64.02 
 
 		 226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  59.63 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  59.33 
 
 		 223 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  58.82 
 
 		 222 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  58.82 
 
 		 222 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  58.82 
 
 		 222 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  52.29 
 
 		 232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  52.31 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  52.11 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  51.64 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  50.23 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  52.24 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  50.7 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  48.8 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  46.15 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  49.54 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  51.24 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  50.23 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  45.54 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  47.2 
 
 		 234 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  47.69 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  46.76 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  46.61 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  46.26 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  45.58 
 
 		 389 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  45.1 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  41.52 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.87 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.94 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.94 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.94 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.92 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.92 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.48 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  34.24 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  31.31 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.34 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 		 252 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.67 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  33.17 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  33.17 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.2 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  37.58 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.4 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  34.17 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  32.98 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  33.71 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  32.76 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>