More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3053 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  82.17 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  82.17 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  75.78 
 
 		 240 aa  356  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  69.09 
 
 		 236 aa  320  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  67.61 
 
 		 228 aa  307  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  69.86 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  69.44 
 
 		 226 aa  288  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  69.16 
 
 		 226 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  68.2 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  68.98 
 
 		 226 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  65.09 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  62.27 
 
 		 223 aa  281  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  58.72 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  58.72 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  58.53 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  56.7 
 
 		 236 aa  262  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  58.8 
 
 		 223 aa  261  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  58.53 
 
 		 222 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  57.47 
 
 		 225 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  62.15 
 
 		 222 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  62.15 
 
 		 222 aa  256  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  62.15 
 
 		 222 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  55.61 
 
 		 225 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  57 
 
 		 227 aa  237  9e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  60.47 
 
 		 229 aa  237  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  55.09 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  52.42 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  51.36 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  48.4 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  52.38 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  52.38 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  50 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  45.63 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  50.67 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  49.55 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  47.75 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  47.56 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  48.66 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  48.66 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  47.11 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  46.93 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  48.66 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  43.69 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  46.49 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  44.8 
 
 		 389 aa  191  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  44.7 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  40.27 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.31 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  35.68 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.7 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.25 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.25 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.25 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.25 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.8 
 
 		 231 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.77 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.13 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.96 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 248 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.38 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.63 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  33.19 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 201 aa  95.5  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.92 
 
 		 246 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  33.78 
 
 		 248 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 201 aa  92.4  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  31.84 
 
 		 256 aa  91.7  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.03 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.18 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  34.95 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.18 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  28.7 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.88 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>