More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0273 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  81.33 
 
 		 232 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  83.04 
 
 		 231 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  77.63 
 
 		 227 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  77.16 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  78.32 
 
 		 230 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  77.88 
 
 		 239 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  78.32 
 
 		 239 aa  364  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  76.99 
 
 		 230 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  76.34 
 
 		 234 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  76.62 
 
 		 233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  76.42 
 
 		 228 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  75 
 
 		 234 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  77.23 
 
 		 228 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  72.96 
 
 		 233 aa  352  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  73.64 
 
 		 247 aa  334  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  68.42 
 
 		 230 aa  333  9e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  72.89 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  71.24 
 
 		 227 aa  331  7.000000000000001e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  51.77 
 
 		 389 aa  251  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  51.5 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  55.76 
 
 		 236 aa  224  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  50.91 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  52.19 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  53.6 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  53.88 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  53.15 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  52.7 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  50.89 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  47.25 
 
 		 227 aa  206  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  48.21 
 
 		 222 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  46.88 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  48.03 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  53.85 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  49.77 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  52.91 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  49.55 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  52.44 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  52.44 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  50.67 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  50.67 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  50.67 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  52.31 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  51.2 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  47.51 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  46.76 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  45.54 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  48.15 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  39.21 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  37.88 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  36.97 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  36.67 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  34.05 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.34 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.84 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.28 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.84 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.15 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.58 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.53 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  34.76 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.73 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 247 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 201 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.11 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  33.15 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 213 aa  85.1  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.8 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  29.46 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.64 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  32.39 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  35.59 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>