More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1165 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  94.74 
 
 		 228 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  79.65 
 
 		 227 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  77.19 
 
 		 230 aa  360  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  77.83 
 
 		 233 aa  360  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  76.75 
 
 		 230 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  74.55 
 
 		 239 aa  353  8.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  77.23 
 
 		 234 aa  353  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  74.34 
 
 		 239 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  75.11 
 
 		 234 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  74.55 
 
 		 239 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  75.58 
 
 		 234 aa  349  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  74.56 
 
 		 231 aa  347  8e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  72.89 
 
 		 232 aa  343  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  74.22 
 
 		 233 aa  342  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  74.31 
 
 		 227 aa  335  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  68.47 
 
 		 230 aa  330  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  70.32 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  69.68 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  53.54 
 
 		 389 aa  255  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  53.39 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  53.46 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 240 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  52.02 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  50.69 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  53.21 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  53.5 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  52.27 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  51.82 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  50.46 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  52.38 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  47.85 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  51.29 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  51.29 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  47.42 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  50.49 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  48.83 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  51.26 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  46.95 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  49.1 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  49.1 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  49.1 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  45.83 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  46.54 
 
 		 232 aa  191  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  48.33 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  52.08 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  43.46 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  48.04 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  51.24 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  35.74 
 
 		 281 aa  148  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  39.09 
 
 		 266 aa  147  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  34.74 
 
 		 264 aa  124  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  38.5 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  35.42 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  34.76 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  34.29 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  34.29 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  34.29 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  35.75 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  35.2 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.66 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  34.08 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.99 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  35.82 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 258 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  34.83 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 191 aa  91.7  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.22 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 201 aa  85.5  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 205 aa  85.1  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  30.58 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.5 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.65 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  37.5 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>