More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1459 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
200 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  35.11 
 
 
190 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  35.11 
 
 
190 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  35.11 
 
 
190 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  35.11 
 
 
190 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  35.11 
 
 
190 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  35.11 
 
 
190 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  35.11 
 
 
190 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  35.11 
 
 
190 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  40.69 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  40.69 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  40.69 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  40.69 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  40.69 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
227 aa  92  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.28 
 
 
197 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
236 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  32.77 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
247 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
239 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.6 
 
 
228 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  24.04 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  35 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.16 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.87 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
228 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  26.44 
 
 
533 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 
213 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  26.63 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  28.34 
 
 
274 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  30.34 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.4 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.42 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.27 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  26.9 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  33.02 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  27.96 
 
 
389 aa  72.4  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  28.22 
 
 
207 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.77 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 
234 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  40.18 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  28.42 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  38.2 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  25.65 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  33.12 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  33.12 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  33.12 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  33.12 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  25.13 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>