More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1123 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  96.44 
 
 
226 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  95.56 
 
 
226 aa  401  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  81.9 
 
 
223 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  73.36 
 
 
228 aa  332  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  75 
 
 
233 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  71.5 
 
 
240 aa  304  7e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  67.76 
 
 
236 aa  296  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  69.16 
 
 
230 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  66.2 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  65.73 
 
 
231 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  65.73 
 
 
231 aa  279  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  66.67 
 
 
222 aa  279  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  66.67 
 
 
222 aa  279  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  66.67 
 
 
222 aa  279  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  70.56 
 
 
230 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  70.56 
 
 
230 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  62.96 
 
 
223 aa  271  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  62.04 
 
 
223 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  58.64 
 
 
227 aa  260  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  59.36 
 
 
225 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  57.41 
 
 
222 aa  254  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  57.41 
 
 
222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  58.45 
 
 
225 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  60 
 
 
236 aa  251  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  57.53 
 
 
232 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  64.02 
 
 
229 aa  238  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  52.04 
 
 
233 aa  234  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  55 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  55 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  55 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  52.42 
 
 
231 aa  231  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  51.77 
 
 
230 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  52.21 
 
 
230 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  53.78 
 
 
233 aa  231  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  52.51 
 
 
227 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  50.9 
 
 
234 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  50.45 
 
 
234 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  52.49 
 
 
228 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  47.32 
 
 
230 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  52.25 
 
 
227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  47.79 
 
 
281 aa  224  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  53.49 
 
 
247 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  52.29 
 
 
228 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  54.34 
 
 
241 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  52.7 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  51.34 
 
 
232 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  48.87 
 
 
389 aa  204  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  49.03 
 
 
231 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  44.59 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  33.76 
 
 
266 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  34.25 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.62 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.64 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  33.03 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
231 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.43 
 
 
231 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
231 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  32.58 
 
 
231 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  32.58 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  32.58 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  31.98 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 
233 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  36.2 
 
 
248 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 
224 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  34.98 
 
 
258 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  35.29 
 
 
227 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  32.31 
 
 
274 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  36.2 
 
 
247 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  35.84 
 
 
212 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  36.2 
 
 
248 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
214 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  32.05 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 
192 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  32.05 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  33.49 
 
 
230 aa  95.5  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 
190 aa  95.1  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.48 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.41 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
197 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  34 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
237 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
203 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  38.55 
 
 
211 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  38.69 
 
 
187 aa  85.5  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
180 aa  85.5  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  35.03 
 
 
197 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>