More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0732 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  72.29 
 
 		 236 aa  352  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  70.91 
 
 		 240 aa  322  5e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  69.23 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  68.87 
 
 		 228 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  68 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  68 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  67.46 
 
 		 223 aa  284  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  67.13 
 
 		 226 aa  279  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  66.2 
 
 		 226 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 		 226 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  66.06 
 
 		 233 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  66.98 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  66.98 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  66.98 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  61.29 
 
 		 223 aa  271  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  60.18 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  60.93 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  59.82 
 
 		 223 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  56.22 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  56.68 
 
 		 222 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  56.76 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  56.88 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  56.62 
 
 		 222 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  57.41 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  55.95 
 
 		 233 aa  242  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  53.78 
 
 		 231 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  53.42 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  53.3 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  53.78 
 
 		 230 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  51.32 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  53.78 
 
 		 230 aa  234  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  52.19 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  57.14 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  60.75 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  54.71 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  54.71 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  52.02 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  54.42 
 
 		 239 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  53.24 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  51.56 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  50.22 
 
 		 234 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  51.79 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  50.22 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  46.77 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  45.5 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  47.23 
 
 		 389 aa  208  7e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  47.48 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  43.95 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  36.32 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  35.87 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  35.87 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  35.87 
 
 		 231 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  35.87 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  35.43 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  35.43 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  34.78 
 
 		 274 aa  124  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.48 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  33.04 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.48 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.13 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.88 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  35.27 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.8 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  30.04 
 
 		 214 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 201 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  31.79 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.22 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29.96 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  30.67 
 
 		 377 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 329 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 192 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  29.69 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  29.69 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.86 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>