More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0399 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
192 aa  391  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  79.89 
 
 
193 aa  322  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  75.26 
 
 
190 aa  302  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  68.42 
 
 
190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  67.2 
 
 
192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  44.21 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  42.02 
 
 
203 aa  155  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 
201 aa  148  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  42.7 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
196 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  44.27 
 
 
201 aa  143  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  41.75 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  39.38 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.08 
 
 
227 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 
172 aa  98.2  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  28.06 
 
 
212 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
329 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 
213 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 
174 aa  91.7  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
213 aa  91.3  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
174 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
217 aa  84.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  27.38 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  32.37 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.67 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.81 
 
 
230 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  26.79 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  34.91 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 
230 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
225 aa  81.3  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  31.5 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.95 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.12 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.15 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  26.79 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  29.06 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  30.36 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  26.79 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.38 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  26.79 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  26.79 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  29.51 
 
 
287 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  26.79 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  26.79 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.63 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  26.97 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  26.79 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4376  Nicotinamidase  32.45 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.540269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  30.27 
 
 
283 aa  78.2  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.44 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1170  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 
248 aa  77.8  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.158821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  27.27 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  29.57 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  26.79 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  26.79 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  26.79 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  26.79 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  26.79 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  26.79 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  30.56 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  30.56 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  30.56 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  30.56 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  30.93 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0036  nicotinamidase  30.93 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  30.81 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  30.99 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  26.32 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  32.53 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  30 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>