More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5517 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  79.81 
 
 		 211 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  47.39 
 
 		 212 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  49.26 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  44.83 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  29.56 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  26.09 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  26.05 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 377 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  24.21 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  27.43 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  31.48 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  31.71 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.71 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.74 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  31.71 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  31.71 
 
 		 187 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0771  isochorismatase family protein  29.82 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  33.13 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  32.92 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  27.84 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  28.71 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  31.9 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  40.24 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.29 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.62 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  24.46 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  30.54 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  30.54 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  37.19 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  28.31 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  28.49 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  39.02 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.52 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  31.97 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  24.53 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  32.54 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1030  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  23.77 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  23.58 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  27.48 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  26.6 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  24.66 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  24.22 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  24.29 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  29.11 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  23.85 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  24.22 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  33.33 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  24.22 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  24.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  27.84 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  24.22 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>