199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2078 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  59.43 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  58.29 
 
 		 215 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  46.67 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  26.39 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.33 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  28.81 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.78 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11593  hypothetical protein  26.4 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.4 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.47 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  25.71 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  48.08 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  26.04 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  27.12 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  42.42 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  27.37 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  23.33 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  26.98 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  24.44 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  48.98 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  48.98 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  27.14 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  48.98 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  41.1 
 
 		 289 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  44.9 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  39.34 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.59 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  28.82 
 
 		 182 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19830  nicotinamidase-like amidase  25.81 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  37.7 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0123  isochorismatase hydrolase  25.28 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  25.24 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  37.7 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  22.16 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  28.06 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  38.78 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  26.7 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 		 281 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  40.82 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  27.66 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  25 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  26.73 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  24.4 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  28.67 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>