More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5191 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5191  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
202 aa  420  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  71.22 
 
 
212 aa  308  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  64.88 
 
 
209 aa  288  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  46.34 
 
 
211 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  44.83 
 
 
218 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  35.68 
 
 
213 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  32.82 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
201 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 
204 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1100  isochorismatase hydrolase  26.05 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2443  Epoxide hydrolase domain protein  70 
 
 
503 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1616  isochorismatase family protein  25.7 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2596  hypothetical protein  25.12 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C36  amidase  26.74 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2078  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  24.54 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
247 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
342 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0874  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  30.2 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  36.89 
 
 
228 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  24.39 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.43 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  34.45 
 
 
176 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  34.45 
 
 
176 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  34.78 
 
 
359 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 
246 aa  58.2  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.84 
 
 
359 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  31.67 
 
 
168 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  26.29 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  23.58 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  37.04 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  24.75 
 
 
231 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 
231 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 
231 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.8 
 
 
231 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  24.88 
 
 
239 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  24.24 
 
 
231 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  27.47 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  27.07 
 
 
176 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  27.87 
 
 
222 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  27.07 
 
 
176 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  31.71 
 
 
180 aa  54.7  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
203 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  27.07 
 
 
176 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  24.24 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  25.58 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  24.24 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  24.43 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  24.24 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  24.24 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  27.09 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  28 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  26.07 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  25 
 
 
233 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  23.74 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  23.74 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  24.42 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  35.11 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 
231 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 
207 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 
240 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 
232 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 
188 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 
190 aa  52  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  27.64 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  24.15 
 
 
193 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  31.46 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  31.46 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  38.27 
 
 
176 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  31.46 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  23.94 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>