More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6128 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 176 aa  357  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  48.59 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  43.26 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  45.35 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  42.29 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  40.45 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  41.11 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  39.56 
 
 		 193 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  38.92 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  39.13 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  37.5 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  38.89 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  38.04 
 
 		 184 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  39.23 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  34.66 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  36.63 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  36.21 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  32.61 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  33.33 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 		 342 aa  77.4  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  35.83 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  31.18 
 
 		 359 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  30.59 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.41 
 
 		 359 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.58 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  29.41 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  29.41 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  29.41 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.82 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  34.24 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 231 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  29.28 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  29.28 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  29.28 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  35.76 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  31.46 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  29.28 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  29.28 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  32.61 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  28.73 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  31.46 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  31.91 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  31.91 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  26.2 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>