More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0095 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  69.23 
 
 
182 aa  252  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  60.56 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  53.11 
 
 
188 aa  191  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  51.69 
 
 
186 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  49.71 
 
 
188 aa  187  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  51.67 
 
 
188 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  49.14 
 
 
188 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  48.57 
 
 
188 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  49.17 
 
 
197 aa  167  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  49.44 
 
 
202 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  48.9 
 
 
188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  44.32 
 
 
194 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  41.54 
 
 
211 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  43.58 
 
 
183 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  37.44 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  39.23 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  33.93 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 
184 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  29.94 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  30.51 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  29.94 
 
 
184 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  30.51 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  29.94 
 
 
184 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 
186 aa  87  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  29.94 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  29.38 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  29.38 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  34.53 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  29.44 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  30.64 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  30.06 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.94 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  28 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  33.09 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  28.74 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  28.74 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  28.74 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1332  hypothetical protein  29.79 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  28.73 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  28.73 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  31.91 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
289 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  25.68 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  25.54 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15140  hypothetical protein  29.26 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163225  hitchhiker  0.0000214815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  29.33 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  28.81 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  29.19 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  25.41 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  28.96 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>