More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3130 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  63.92 
 
 		 211 aa  242  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  61.26 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  56.77 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1968  isochorismatase hydrolase  42.27 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1463  isochorismatase hydrolase  41.84 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3939  isochorismatase hydrolase  39.9 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0076  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  36.92 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3001  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4299  isochorismatase hydrolase  37.95 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5057  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2619  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 188 aa  98.6  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2922  hydrolase  38.02 
 
 		 188 aa  97.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  35.5 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  37.18 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  34.83 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  34.91 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  29.65 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  33.78 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  33.11 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  33.78 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  33.78 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  27.97 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  32.19 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  32.43 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  33.11 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  33.11 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  23.78 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  31.51 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.28 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  29.84 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  33.81 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  31.11 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  35.22 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.37 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  27.97 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2233  isochorismatase superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  29.14 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  31.93 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  28.48 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  27.27 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.86 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  39.53 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  27.27 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.81 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  36.81 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3507  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  27.97 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  27.97 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  27.97 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  33.59 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  25.64 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  26.99 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  28.67 
 
 		 359 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  26.99 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  29.71 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  31.88 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  34.71 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>