More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2126 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  68.39 
 
 
195 aa  243  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  68.67 
 
 
212 aa  235  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  67.84 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  45.76 
 
 
190 aa  177  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3001  isochorismatase hydrolase  51.11 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439517  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  51.74 
 
 
186 aa  167  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  43.09 
 
 
184 aa  160  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  43.09 
 
 
184 aa  160  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  41.76 
 
 
184 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  42.54 
 
 
184 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  41.85 
 
 
185 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1252  isochorismatase family protein  41.3 
 
 
185 aa  157  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00425084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1416  isochorismatase family protein  40.22 
 
 
184 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  41.76 
 
 
184 aa  150  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  43.33 
 
 
191 aa  147  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  44.32 
 
 
193 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  42.29 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  40.66 
 
 
188 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  42.61 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  45.35 
 
 
176 aa  131  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03429  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12220)  38.99 
 
 
230 aa  111  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422147  normal  0.109574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 
196 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  34.27 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
196 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  40.23 
 
 
199 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 
218 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 
223 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  32.16 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  32.16 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  32.16 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
207 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  31.58 
 
 
187 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 
201 aa  90.9  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  43.7 
 
 
226 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  31.58 
 
 
187 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  31.58 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  31.58 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  33.72 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  43.7 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  40.46 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  31.67 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
289 aa  88.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2494  isochorismatase hydrolase  40.85 
 
 
198 aa  88.6  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  52.5 
 
 
226 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  31.58 
 
 
181 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 
185 aa  87.8  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  31.58 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 
196 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  34.91 
 
 
196 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  33.72 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.93 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  28.26 
 
 
359 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0158  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  33.91 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 
223 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  33.91 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
198 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  28.26 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  28.26 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  28.26 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2520  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  40.52 
 
 
234 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  31.35 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  35.77 
 
 
239 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>