More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1290 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
209 aa  432  1e-120  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  39.88 
 
 
184 aa  128  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  44.19 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 
194 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 
194 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 
199 aa  89  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
180 aa  84.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 
231 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 
231 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  27.13 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  24.49 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30.52 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  35.92 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  31.08 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.16 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  26.26 
 
 
291 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  30.85 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  40.82 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  40.82 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  27.27 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  40.82 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  25.14 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  25.39 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  26.17 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  25.54 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  27.57 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  28.65 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  29.61 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  28.11 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  28.57 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  27.53 
 
 
285 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  26.97 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  27.42 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  24.24 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  26.15 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  28.49 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  31.11 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  30.98 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  31.11 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  27.37 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  30.94 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  27.37 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  31.11 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  31.11 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  26.45 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  27.37 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  27.37 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  27.37 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  27.37 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  27.37 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  27.37 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.65 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  28.73 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  31.11 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  31.11 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  27.37 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  25.52 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  27.05 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>