More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5733 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  91.4 
 
 		 187 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  87.7 
 
 		 187 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  87.7 
 
 		 187 aa  331  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  88.24 
 
 		 187 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  69.95 
 
 		 191 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  69.02 
 
 		 187 aa  257  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  68.45 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  64.86 
 
 		 187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  63.59 
 
 		 185 aa  228  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  60.96 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  57.14 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  61.2 
 
 		 188 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  57.51 
 
 		 193 aa  200  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  49.5 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  44.79 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  44.79 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  45.41 
 
 		 195 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  44.02 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 190 aa  136  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  42.54 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  41.11 
 
 		 190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  42.55 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  45.45 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  46.47 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  45.45 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  40.76 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  40.76 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  40.76 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  40.76 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  40.76 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  41.76 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  41.21 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  37.57 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  43.5 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  39.29 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  34.25 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  37.59 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  36.57 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  34.75 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  30.26 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  37.33 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  31.35 
 
 		 258 aa  72  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.89 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0757  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000750492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.92 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.95 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.93 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.89 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  30.63 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  36.96 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  26.19 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  30.41 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  28.35 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.48 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>