More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2026 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 218 aa  433  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  43.15 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1766  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  39.09 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  38.01 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.24 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 185 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 185 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  34.81 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  32.6 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  32.6 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  34.59 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  32.6 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  32.6 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  32.6 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  32.6 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.06 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  32.6 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  32.04 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  30.5 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.59 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  32.83 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5987  putative isochorismatase family protein  34.76 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  26.11 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  35.53 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.18 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  29.53 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.64 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  30.39 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  34.57 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  30.39 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  30.39 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  30.34 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  28.36 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.78 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.22 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.22 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.22 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.22 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  28.96 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  26.88 
 
 		 359 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  32.84 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  28.14 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  30.69 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  29.5 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  30.51 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  32.43 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  32.08 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  34.86 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  29.67 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  26.21 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>