More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3660 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  34.4 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  42.01 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33.94 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33.94 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.94 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  33.94 
 
 		 231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  40.83 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  33.49 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 248 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  36.97 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  34.4 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  32.58 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  42.65 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.64 
 
 		 241 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  31.38 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  33.94 
 
 		 258 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  36.42 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  34.81 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.36 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 235 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  33.65 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 		 193 aa  95.5  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.3 
 
 		 180 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 172 aa  94  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 		 192 aa  92  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 248 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  34.42 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.69 
 
 		 246 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  27.7 
 
 		 389 aa  89.4  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.31 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  26.52 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  27.43 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  26.5 
 
 		 329 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.52 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  36.03 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.39 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4718  hypothetical protein  36.56 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  28.3 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  29.22 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  26.76 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.21 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  27.95 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  29.38 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  29.14 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  27.83 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  30.29 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  28.57 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>