More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21200 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  100 
 
 
278 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  51.64 
 
 
287 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  57.04 
 
 
291 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  48.56 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  44.96 
 
 
295 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  44.96 
 
 
295 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  45.32 
 
 
295 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  45 
 
 
297 aa  276  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  45.36 
 
 
297 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  44.96 
 
 
295 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  44.96 
 
 
295 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  44.96 
 
 
295 aa  275  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  45 
 
 
297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  50 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  49.28 
 
 
291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  45.8 
 
 
296 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  49.83 
 
 
327 aa  267  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  47.83 
 
 
284 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  49.1 
 
 
299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  44.64 
 
 
297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  48.2 
 
 
285 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  48.2 
 
 
285 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0544005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  46.91 
 
 
285 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  46.91 
 
 
285 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  46.91 
 
 
285 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  46.91 
 
 
285 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  48.2 
 
 
285 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  46.91 
 
 
285 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  46.91 
 
 
285 aa  264  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  48.2 
 
 
285 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  46.57 
 
 
291 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  46.91 
 
 
285 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  46.91 
 
 
285 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  47.84 
 
 
285 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  47.14 
 
 
294 aa  260  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  46.18 
 
 
285 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  41.7 
 
 
297 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  48.19 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  46.21 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  47.83 
 
 
290 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  47.94 
 
 
285 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  42.45 
 
 
283 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.78 
 
 
319 aa  222  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  41.01 
 
 
270 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  39.02 
 
 
264 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  51.44 
 
 
221 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  50.74 
 
 
212 aa  201  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  53.44 
 
 
207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  44.83 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  47.03 
 
 
216 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  48.74 
 
 
218 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  47.5 
 
 
211 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.05 
 
 
207 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  45.5 
 
 
221 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  46.77 
 
 
220 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.05 
 
 
207 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  47.21 
 
 
251 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.32 
 
 
207 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.32 
 
 
207 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  45.59 
 
 
201 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  43.94 
 
 
207 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  40.22 
 
 
260 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  47.62 
 
 
2350 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25.26 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.33 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1868  isochorismatase  48.53 
 
 
84 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  47.06 
 
 
1131 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  32.11 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.08 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  27.8 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  38.89 
 
 
2230 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 
192 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  27.23 
 
 
533 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
186 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  34.18 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 
172 aa  63.5  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
233 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  25.6 
 
 
184 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.37 
 
 
188 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 
222 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.17 
 
 
228 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>