More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4714 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  71.04 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  70.49 
 
 		 187 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  69.95 
 
 		 187 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  69.95 
 
 		 187 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  69.95 
 
 		 187 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  66.12 
 
 		 187 aa  258  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  68.85 
 
 		 187 aa  257  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  68.85 
 
 		 187 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  65.03 
 
 		 187 aa  251  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  59.89 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  61.54 
 
 		 187 aa  230  8.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 		 185 aa  225  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  61.2 
 
 		 188 aa  221  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  54.05 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  52.91 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  48.24 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  41.58 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  41.58 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  42.27 
 
 		 195 aa  147  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  39.25 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  42.93 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  41.88 
 
 		 199 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  43.26 
 
 		 190 aa  124  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  39.27 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  40.33 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  40.33 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  40.33 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  40.33 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  40.33 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  38.33 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  44.89 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  38.12 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  38.12 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  38.12 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  38.12 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  38.12 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  38.12 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  37.57 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  37.7 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  33.51 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 		 166 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  37.11 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 		 342 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.69 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  31.25 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  35.23 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  31.69 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  37.58 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  31.58 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  38 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  37.87 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.15 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  32.87 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.72 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  35.92 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  33.94 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  32.95 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  31.17 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.59 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  35.62 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>