More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3277 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  96.48 
 
 		 199 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  64.17 
 
 		 192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  58.82 
 
 		 188 aa  234  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  58.82 
 
 		 188 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  58.82 
 
 		 188 aa  234  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  58.82 
 
 		 188 aa  234  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  58.82 
 
 		 188 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  58.82 
 
 		 188 aa  234  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  58.82 
 
 		 188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  58.29 
 
 		 188 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  58.95 
 
 		 188 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  56.68 
 
 		 188 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  56.68 
 
 		 188 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  56.68 
 
 		 188 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  56.68 
 
 		 188 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  56.68 
 
 		 188 aa  225  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  54.84 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  52.15 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  51.08 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  45.96 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  45.6 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  48.21 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  43.08 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  44.26 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  44.26 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  43.72 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  44.1 
 
 		 185 aa  141  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  36.87 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  39.49 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  46.77 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  43.01 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  44.02 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  45.11 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  42.49 
 
 		 187 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  40.93 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  41.97 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  40.22 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1105  isochorismatase  61.43 
 
 		 84 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.88 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  32.96 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.56 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  30.35 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  33.94 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.09 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.28 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  28.64 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  34.85 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  28.7 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29.69 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.24 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  33.54 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.6 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  39.58 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.35 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.27 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  33.52 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>