More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00897 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 		 197 aa  207  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  47.69 
 
 		 195 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  45.95 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  45.56 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  47.31 
 
 		 189 aa  153  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  40.78 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  40.72 
 
 		 223 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  39.27 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  39.23 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  40.12 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  47.41 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  39.66 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  39.15 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  35.56 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  45.19 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  36.57 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  34.68 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 217 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  31.19 
 
 		 533 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  31.51 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  35.03 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  28.8 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  34.27 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  34.27 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  31 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  34.75 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  35.29 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  35.29 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  35.29 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.33 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34.3 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  35.29 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.52 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  35.29 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  30.61 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  34.01 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  34.01 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  38.41 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  34.52 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  31.61 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  31.61 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  49.35 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  31.61 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  31.61 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  31.61 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  31.61 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30.18 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  31.09 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  28.7 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  31.68 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  32.43 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  30.35 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  30.35 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1856  isochorismatase hydrolase  45.68 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  28.19 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  30.77 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  33.51 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.69 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.69 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  29.08 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>