More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6045 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  71.01 
 
 		 213 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  71.01 
 
 		 213 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  71.01 
 
 		 213 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  70.33 
 
 		 213 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  72.46 
 
 		 211 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  57 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  57.28 
 
 		 214 aa  231  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  52.13 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  47.76 
 
 		 209 aa  187  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  48.21 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  46.7 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  50.26 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  47.8 
 
 		 242 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  45.1 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  44.85 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  44 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  38.94 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  41.29 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  41.15 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  41.71 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  37.38 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  42.86 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  41.08 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  42.53 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  36.18 
 
 		 247 aa  134  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  44.51 
 
 		 198 aa  131  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  35.78 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  37.75 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  37.02 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  33.66 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  37.97 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.98 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  32.2 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  33.74 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  33.74 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  36.94 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  28.19 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  35.66 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.35 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  32.81 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27.72 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  24.87 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.23 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  33.94 
 
 		 683 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  30.89 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  28.85 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  31.68 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  24.88 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  27.18 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>