More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3491 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  92.89 
 
 		 227 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  75.86 
 
 		 210 aa  315  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  57.28 
 
 		 213 aa  231  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  54.46 
 
 		 211 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  52.61 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  52.61 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  51.87 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  51.85 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  48.56 
 
 		 218 aa  207  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  50.24 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  49.5 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  52.58 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  50.5 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  43.72 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  47.59 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  43.46 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  43.16 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  42.57 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  47.21 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  42.64 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  38.32 
 
 		 247 aa  151  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  41.09 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  41.97 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  41.97 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  41.97 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 		 198 aa  144  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  36.15 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  36.19 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  38.65 
 
 		 210 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  36.95 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  40.58 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  39.61 
 
 		 252 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  29.29 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  33.51 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 191 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  23.15 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 188 aa  72  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.69 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.64 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  28.41 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  24.6 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  24.6 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.3 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  29.38 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  26.5 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  30.18 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  31.9 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  29.52 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.03 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.58 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  32.17 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  25.37 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.47 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  34.59 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.34 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  25.38 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  30.3 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>