More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4551 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  94.39 
 
 
215 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  94.39 
 
 
215 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  94.39 
 
 
215 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  73.43 
 
 
231 aa  307  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  71.84 
 
 
224 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  74.23 
 
 
211 aa  297  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  71.43 
 
 
208 aa  295  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  70.39 
 
 
216 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  62.5 
 
 
213 aa  264  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  42.21 
 
 
227 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  39.81 
 
 
210 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  41.09 
 
 
214 aa  151  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  39.81 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  43.17 
 
 
213 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  40.3 
 
 
207 aa  141  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  44.09 
 
 
211 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  43.33 
 
 
213 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  43.33 
 
 
213 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  42.62 
 
 
213 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  41.94 
 
 
213 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 
209 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  34.98 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  40.32 
 
 
215 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  34.2 
 
 
218 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  36.32 
 
 
227 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  45.6 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  40.2 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
210 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  34.72 
 
 
219 aa  95.5  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  29.17 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  29.2 
 
 
251 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  36.36 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  32.28 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  29.41 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
226 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.89 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.46 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.07 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  32.2 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  32.2 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  32.2 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  30.29 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30.27 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  31.75 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  31.29 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.18 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.47 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  24.19 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  30.91 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.11 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  33.76 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.34 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  31.22 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  28.86 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  25.67 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  26.18 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  26.67 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  37.96 
 
 
199 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 
190 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.8 
 
 
244 aa  62  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  31.98 
 
 
207 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27.62 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  26.53 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>