More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4359 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  48.31 
 
 
227 aa  210  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  50 
 
 
216 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  48.56 
 
 
214 aa  207  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  49.03 
 
 
210 aa  203  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  45.89 
 
 
208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  46.7 
 
 
213 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  48.39 
 
 
209 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  43.12 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  43.12 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  48.45 
 
 
211 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  42.66 
 
 
213 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  45.36 
 
 
213 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  41.58 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  46.81 
 
 
198 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  40.41 
 
 
207 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  41.8 
 
 
242 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  40.66 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  35.02 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  37.85 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 
213 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 
210 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 
208 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 
231 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  36.24 
 
 
219 aa  121  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  34.57 
 
 
211 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
215 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
215 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 
224 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  31.7 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  36.45 
 
 
251 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  34.11 
 
 
252 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
221 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  34.69 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 
213 aa  81.3  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  27.93 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  27.93 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  27.93 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  27.93 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  27.93 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  26.78 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  29.41 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  27.93 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  26.88 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  26.88 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  26.88 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  26.88 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  26.88 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  27.37 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.13 
 
 
244 aa  64.7  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  33.75 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.22 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  25.52 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.62 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  26.56 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 
197 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
199 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.82 
 
 
193 aa  61.6  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  28.73 
 
 
218 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  28.4 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  26.34 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  29.93 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
289 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 
186 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  28.92 
 
 
231 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.92 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>