More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0856 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  70.39 
 
 		 247 aa  343  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  39.35 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  40.19 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  36.15 
 
 		 214 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  37.38 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  37.85 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  39.69 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  39.05 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  36.15 
 
 		 213 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  38.65 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  38.65 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  36.82 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  35.48 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  41.88 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  34.02 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  28.17 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  33.33 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 215 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 219 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  29.68 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  27.04 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  33.06 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  30.88 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  27.22 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.18 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  26.67 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  28.07 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  28.48 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  27.51 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  24.43 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  25.28 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  23.64 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  25.29 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  25.79 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  26.99 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  24.62 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  30.77 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  22.93 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  23.72 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  23.72 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  25.38 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  23.72 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  28.77 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  27.95 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.76 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  40.58 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  27.27 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  25.95 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  25.37 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  27.07 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2915  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  27.12 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  23.91 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>