More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1129 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  56.72 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  51.47 
 
 		 211 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  53.16 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  49.27 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  49.48 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  46.89 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  46.89 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  46.89 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  47.14 
 
 		 213 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  51.49 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  48.22 
 
 		 214 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  48.53 
 
 		 207 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  41.46 
 
 		 216 aa  161  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  41.8 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  41.15 
 
 		 208 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  41.53 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  41.5 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  39.9 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  41.62 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  39.7 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  40.76 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  39.59 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  41.3 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  32.68 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  32.66 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  35.92 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  40.4 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  32.79 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  23.66 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  29.82 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.11 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  28.39 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  38.54 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 203 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  27.85 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  30.92 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  38.95 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  25.15 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2624  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.722886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  26.53 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  40.74 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.99 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  32.89 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  28.43 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  29.61 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  24.56 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  24.56 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  25.25 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  25.25 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  25.51 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  39.51 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>