182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4372 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  98.1 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  79.05 
 
 		 211 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  78.57 
 
 		 243 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  82.89 
 
 		 217 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  82.89 
 
 		 217 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  82.89 
 
 		 217 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  81.82 
 
 		 189 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  78.61 
 
 		 212 aa  304  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  80.9 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  74.62 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  75.41 
 
 		 189 aa  290  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  75.41 
 
 		 189 aa  290  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  78.07 
 
 		 189 aa  286  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  39.66 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  40.12 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  38.59 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  40.46 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 189 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  43.28 
 
 		 135 aa  92  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  33.88 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  28.66 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  29.41 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.28 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.28 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.28 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.28 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.28 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  31.13 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  32.56 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  28.68 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  27.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  27.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  30.68 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  25.14 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  28.99 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  24.6 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  24.6 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  30.43 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  27.22 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  41.77 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  29.59 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  37.8 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  25.56 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  28.67 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  29.83 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  30.88 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.17 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1793  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  26.74 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  31.45 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  26.45 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  24.42 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  37.18 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  27.42 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  25.58 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  25.56 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  26.49 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  29.53 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  29.28 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  24.75 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  23.67 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  26.78 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  23.84 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  26.9 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>